Schmittges 2016 Track Settings

JavaScript is disabled in your web browser

You must have JavaScript enabled in your web browser to use the Genome Browser

Schmittges 2016 ZNF ChIP SEQ

Display mode: Reset to defaults

All subtracks:

List subtracks: only selected/visible all ()
	hide	GSM2026739_FEZF1_rep1	GSM2026739_FEZF1_rep1	Data format
	hide	GSM2026740_ZNF320_rep1	GSM2026740_ZNF320_rep1	Data format
	hide	GSM2026741_ZNF320_rep2	GSM2026741_ZNF320_rep2	Data format
	hide	GSM2026742_ZBTB42_rep1	GSM2026742_ZBTB42_rep1	Data format
	hide	GSM2026743_ZNF263_rep1	GSM2026743_ZNF263_rep1	Data format
	hide	GSM2026744_ZNF264_rep1	GSM2026744_ZNF264_rep1	Data format
	hide	GSM2026745_ZBTB14_rep1	GSM2026745_ZBTB14_rep1	Data format
	hide	GSM2026746_ZNF354A_rep1	GSM2026746_ZNF354A_rep1	Data format
	hide	GSM2026747_ZNF324_rep1	GSM2026747_ZNF324_rep1	Data format
	hide	GSM2026748_PRDM1_rep1	GSM2026748_PRDM1_rep1	Data format
	hide	GSM2026749_KLF7_rep1	GSM2026749_KLF7_rep1	Data format
	hide	GSM2026750_SNAI1_rep1	GSM2026750_SNAI1_rep1	Data format
	hide	GSM2026751_SNAI1_rep2	GSM2026751_SNAI1_rep2	Data format
	hide	GSM2026752_SNAI1_rep3	GSM2026752_SNAI1_rep3	Data format
	hide	GSM2026753_SP1_rep1	GSM2026753_SP1_rep1	Data format
	hide	GSM2026754_ZSCAN22_rep1	GSM2026754_ZSCAN22_rep1	Data format
	hide	GSM2026755_ZSCAN22_rep3	GSM2026755_ZSCAN22_rep3	Data format
	hide	GSM2026756_ZSCAN22_rep4	GSM2026756_ZSCAN22_rep4	Data format
	hide	GSM2026757_ZBTB48_rep1	GSM2026757_ZBTB48_rep1	Data format
	hide	GSM2026758_GLI4_rep1	GSM2026758_GLI4_rep1	Data format
	hide	GSM2026759_EGR2_rep1	GSM2026759_EGR2_rep1	Data format
	hide	GSM2026760_EGR2_rep2	GSM2026760_EGR2_rep2	Data format
	hide	GSM2026761_ZNF35_rep2	GSM2026761_ZNF35_rep2	Data format
	hide	GSM2026762_ZNF250_rep2	GSM2026762_ZNF250_rep2	Data format
	hide	GSM2026763_ZNF708_rep1	GSM2026763_ZNF708_rep1	Data format
	hide	GSM2026764_ZNF18_rep1	GSM2026764_ZNF18_rep1	Data format
	hide	GSM2026765_ZNF22_rep1	GSM2026765_ZNF22_rep1	Data format
	hide	GSM2026766_ZNF22_rep2	GSM2026766_ZNF22_rep2	Data format
	hide	GSM2026767_ZNF22_rep3	GSM2026767_ZNF22_rep3	Data format
	hide	GSM2026768_ZNF22_rep4	GSM2026768_ZNF22_rep4	Data format
	hide	GSM2026769_ZNF22_rep5	GSM2026769_ZNF22_rep5	Data format
	hide	GSM2026770_ZNF37A_rep1	GSM2026770_ZNF37A_rep1	Data format
	hide	GSM2026771_ZNF30_rep1	GSM2026771_ZNF30_rep1	Data format
	hide	GSM2026772_ZNF30_rep2	GSM2026772_ZNF30_rep2	Data format
	hide	GSM2026773_ZNF30_rep3	GSM2026773_ZNF30_rep3	Data format
	hide	GSM2026774_ZNF8_rep1	GSM2026774_ZNF8_rep1	Data format
	hide	GSM2026775_YY1_rep1	GSM2026775_YY1_rep1	Data format
	hide	GSM2026776_YY1_rep2	GSM2026776_YY1_rep2	Data format
	hide	GSM2026777_YY1_rep4	GSM2026777_YY1_rep4	Data format
	hide	GSM2026778_MZF1_rep2	GSM2026778_MZF1_rep2	Data format
	hide	GSM2026779_ZNF76_rep1	GSM2026779_ZNF76_rep1	Data format
	hide	GSM2026780_CTCF_rep1	GSM2026780_CTCF_rep1	Data format
	hide	GSM2026781_CTCF_rep2	GSM2026781_CTCF_rep2	Data format
	hide	GSM2026782_CTCF_rep3	GSM2026782_CTCF_rep3	Data format
	hide	GSM2026783_CTCF_rep4	GSM2026783_CTCF_rep4	Data format
	hide	GSM2026784_CTCF_rep5	GSM2026784_CTCF_rep5	Data format
	hide	GSM2026785_CTCF_rep6	GSM2026785_CTCF_rep6	Data format
	hide	GSM2026786_CTCF_rep7	GSM2026786_CTCF_rep7	Data format
	hide	GSM2026787_ZNF41_rep1	GSM2026787_ZNF41_rep1	Data format
	hide	GSM2026788_ZNF41_rep3	GSM2026788_ZNF41_rep3	Data format
	hide	GSM2026789_ZNF136_rep1	GSM2026789_ZNF136_rep1	Data format
	hide	GSM2026790_ZNF140_rep1	GSM2026790_ZNF140_rep1	Data format
	hide	GSM2026791_ZNF134_rep1	GSM2026791_ZNF134_rep1	Data format
	hide	GSM2026792_MAZ_rep1	GSM2026792_MAZ_rep1	Data format
	hide	GSM2026793_ZNF121_rep1	GSM2026793_ZNF121_rep1	Data format
	hide	GSM2026794_ZNF121_rep2	GSM2026794_ZNF121_rep2	Data format
	hide	GSM2026795_ZNF280A_rep1	GSM2026795_ZNF280A_rep1	Data format
	hide	GSM2026796_SP2_rep1	GSM2026796_SP2_rep1	Data format
	hide	GSM2026797_SP4_rep1	GSM2026797_SP4_rep1	Data format
	hide	GSM2026798_SP4_rep2	GSM2026798_SP4_rep2	Data format
	hide	GSM2026799_SP4_rep3	GSM2026799_SP4_rep3	Data format
	hide	GSM2026800_ZNF85_rep1	GSM2026800_ZNF85_rep1	Data format
	hide	GSM2026801_ZNF33A_rep1	GSM2026801_ZNF33A_rep1	Data format
	hide	GSM2026802_EGR3_rep1	GSM2026802_EGR3_rep1	Data format
	hide	GSM2026803_ZNF816_rep1	GSM2026803_ZNF816_rep1	Data format
	hide	GSM2026804_KLF1_rep1	GSM2026804_KLF1_rep1	Data format
	hide	GSM2026805_ZNF146_rep1	GSM2026805_ZNF146_rep1	Data format
	hide	GSM2026806_ZBTB6_rep1	GSM2026806_ZBTB6_rep1	Data format
	hide	GSM2026807_ZBTB6_rep2	GSM2026807_ZBTB6_rep2	Data format
	hide	GSM2026808_ZBTB6_rep3	GSM2026808_ZBTB6_rep3	Data format
	hide	GSM2026809_ZNF528_rep1	GSM2026809_ZNF528_rep1	Data format
	hide	GSM2026810_ZNF528_rep3	GSM2026810_ZNF528_rep3	Data format
	hide	GSM2026811_ZNF528_rep4	GSM2026811_ZNF528_rep4	Data format
	hide	GSM2026812_ZNF260_rep1	GSM2026812_ZNF260_rep1	Data format
	hide	GSM2026813_ZNF394_rep1	GSM2026813_ZNF394_rep1	Data format
	hide	GSM2026814_ZNF667_rep1	GSM2026814_ZNF667_rep1	Data format
	hide	GSM2026815_ZNF770_rep1	GSM2026815_ZNF770_rep1	Data format
	hide	GSM2026816_ZNF774_rep1	GSM2026816_ZNF774_rep1	Data format
	hide	GSM2026817_ZNF549_rep1	GSM2026817_ZNF549_rep1	Data format
	hide	GSM2026818_ZNF449_rep1	GSM2026818_ZNF449_rep1	Data format
	hide	GSM2026819_ZNF322_rep2	GSM2026819_ZNF322_rep2	Data format
	hide	GSM2026820_ZNF574_rep2	GSM2026820_ZNF574_rep2	Data format
	hide	GSM2026821_ZNF467_rep2	GSM2026821_ZNF467_rep2	Data format
	hide	GSM2026822_ZNF554_rep1	GSM2026822_ZNF554_rep1	Data format
	hide	GSM2026823_ZNF329_rep1	GSM2026823_ZNF329_rep1	Data format
	hide	GSM2026824_ZNF547_rep1	GSM2026824_ZNF547_rep1	Data format
	hide	GSM2026825_ZSCAN29_rep1	GSM2026825_ZSCAN29_rep1	Data format
	hide	GSM2026826_ZNF595_rep1	GSM2026826_ZNF595_rep1	Data format
	hide	GSM2026827_ZNF34_rep1	GSM2026827_ZNF34_rep1	Data format
	hide	GSM2026828_ZFP82_rep1	GSM2026828_ZFP82_rep1	Data format
	hide	GSM2026829_OSR2_rep1	GSM2026829_OSR2_rep1	Data format
	hide	GSM2026830_ZNF513_rep1	GSM2026830_ZNF513_rep1	Data format
	hide	GSM2026831_ZNF454_rep2	GSM2026831_ZNF454_rep2	Data format
	hide	GSM2026832_GLIS1_rep1	GSM2026832_GLIS1_rep1	Data format
	hide	GSM2026833_ZNF784_rep1	GSM2026833_ZNF784_rep1	Data format
	hide	GSM2026834_ZNF680_rep1	GSM2026834_ZNF680_rep1	Data format
	hide	GSM2026835_ZNF680_rep2	GSM2026835_ZNF680_rep2	Data format
	hide	GSM2026836_ZFP28_rep1	GSM2026836_ZFP28_rep1	Data format
	hide	GSM2026837_ZFP28_rep2	GSM2026837_ZFP28_rep2	Data format
	hide	GSM2026838_ZNF563_rep1	GSM2026838_ZNF563_rep1	Data format
	hide	GSM2026839_ZNF502_rep1	GSM2026839_ZNF502_rep1	Data format
	hide	GSM2026840_ZNF502_rep2	GSM2026840_ZNF502_rep2	Data format
	hide	GSM2026841_ZNF596_rep2	GSM2026841_ZNF596_rep2	Data format
	hide	GSM2026842_ZNF418_rep1	GSM2026842_ZNF418_rep1	Data format
	hide	GSM2026843_ZNF384_rep1	GSM2026843_ZNF384_rep1	Data format
	hide	GSM2026844_GTF3A_rep1	GSM2026844_GTF3A_rep1	Data format
	hide	GSM2026845_ZNF669_rep1	GSM2026845_ZNF669_rep1	Data format
	hide	GSM2026846_ZNF419_rep1	GSM2026846_ZNF419_rep1	Data format
	hide	GSM2026847_ZSCAN31_rep2	GSM2026847_ZSCAN31_rep2	Data format
	hide	GSM2026848_ZFP42_rep1	GSM2026848_ZFP42_rep1	Data format
	hide	GSM2026849_ZFP42_rep2	GSM2026849_ZFP42_rep2	Data format
	hide	GSM2026850_ZNF778_rep1	GSM2026850_ZNF778_rep1	Data format
	hide	GSM2026851_ZNF582_rep1	GSM2026851_ZNF582_rep1	Data format
	hide	GSM2026852_ZNF582_rep2	GSM2026852_ZNF582_rep2	Data format
	hide	GSM2026853_ZIM3_rep1	GSM2026853_ZIM3_rep1	Data format
	hide	GSM2026854_ZNF317_rep2	GSM2026854_ZNF317_rep2	Data format
	hide	GSM2026855_ZNF317_rep3	GSM2026855_ZNF317_rep3	Data format
	hide	GSM2026856_ZNF382_rep1	GSM2026856_ZNF382_rep1	Data format
	hide	GSM2026857_ZNF382_rep2	GSM2026857_ZNF382_rep2	Data format
	hide	GSM2026858_ZNF382_rep3	GSM2026858_ZNF382_rep3	Data format
	hide	GSM2026859_ZNF382_rep4	GSM2026859_ZNF382_rep4	Data format
	hide	GSM2026860_ZNF382_rep5	GSM2026860_ZNF382_rep5	Data format
	hide	GSM2026861_ZBTB18_rep2	GSM2026861_ZBTB18_rep2	Data format
	hide	GSM2026862_ZNF184_rep1	GSM2026862_ZNF184_rep1	Data format
	hide	GSM2026863_SCRT1_rep1	GSM2026863_SCRT1_rep1	Data format
	hide	GSM2026864_ZNF341_rep1	GSM2026864_ZNF341_rep1	Data format
	hide	GSM2026865_ZNF436_rep1	GSM2026865_ZNF436_rep1	Data format
	hide	GSM2026866_ZNF350_rep1	GSM2026866_ZNF350_rep1	Data format
	hide	GSM2026867_ZNF350_rep2	GSM2026867_ZNF350_rep2	Data format
	hide	GSM2026868_ZSCAN16_rep1	GSM2026868_ZSCAN16_rep1	Data format
	hide	GSM2026869_ZSCAN16_rep2	GSM2026869_ZSCAN16_rep2	Data format
	hide	GSM2026870_ZSCAN16_rep3	GSM2026870_ZSCAN16_rep3	Data format
	hide	GSM2026871_ZNF768_rep1	GSM2026871_ZNF768_rep1	Data format
	hide	GSM2026872_PATZ1_rep1	GSM2026872_PATZ1_rep1	Data format
	hide	GSM2026873_ZBTB26_rep1	GSM2026873_ZBTB26_rep1	Data format
	hide	GSM2026874_ZBTB26_rep2	GSM2026874_ZBTB26_rep2	Data format
	hide	GSM2026875_ZFP64_rep1	GSM2026875_ZFP64_rep1	Data format
	hide	GSM2026876_ZFP64_rep2	GSM2026876_ZFP64_rep2	Data format
	hide	GSM2026877_ZFP64_rep3	GSM2026877_ZFP64_rep3	Data format
	hide	GSM2026878_MYNN_rep1	GSM2026878_MYNN_rep1	Data format
	hide	GSM2026879_PRDM6_rep1	GSM2026879_PRDM6_rep1	Data format
	hide	GSM2026880_ZNF331_rep1	GSM2026880_ZNF331_rep1	Data format
	hide	GSM2026881_ZNF331_rep2	GSM2026881_ZNF331_rep2	Data format
	hide	GSM2026882_ZNF586_rep1	GSM2026882_ZNF586_rep1	Data format
	hide	GSM2026883_ZNF224_rep1	GSM2026883_ZNF224_rep1	Data format
	hide	GSM2026884_KLF15_rep1	GSM2026884_KLF15_rep1	Data format
	hide	GSM2026885_KLF15_rep2	GSM2026885_KLF15_rep2	Data format
	hide	GSM2026886_KLF15_rep3	GSM2026886_KLF15_rep3	Data format
	hide	GSM2026887_ZNF214_rep1	GSM2026887_ZNF214_rep1	Data format
	hide	GSM2026888_ZNF490_rep1	GSM2026888_ZNF490_rep1	Data format
	hide	GSM2026889_ZNF257_rep1	GSM2026889_ZNF257_rep1	Data format
	hide	GSM2026890_ZNF257_rep2	GSM2026890_ZNF257_rep2	Data format
	hide	GSM2026891_ZNF281_rep1	GSM2026891_ZNF281_rep1	Data format
	hide	GSM2026892_ZBTB12_rep1	GSM2026892_ZBTB12_rep1	Data format
	hide	GSM2026893_ZBTB12_rep3	GSM2026893_ZBTB12_rep3	Data format
	hide	GSM2026896_ZBTB12_rep4	GSM2026896_ZBTB12_rep4	Data format
	hide	GSM2026898_ZBTB12_rep5	GSM2026898_ZBTB12_rep5	Data format
	hide	GSM2026899_ZBTB12_rep6	GSM2026899_ZBTB12_rep6	Data format
	hide	GSM2026900_ZNF175_rep1	GSM2026900_ZNF175_rep1	Data format
	hide	GSM2026901_KLF12_rep1	GSM2026901_KLF12_rep1	Data format

Assembly: Human Feb. 2009 (GRCh37/hg19)

Description

This track shows the meta summits from data processed from Schmittges et al. 2016 from the Hughes lab. ChIP-SEQ of many GFP tagged ZNFs in HEK293 cells. Not all proteins are human, and not all are KRAB-Zinc fingers proteins.

Methods

We obtained the summits directly from the GEO submissions NCBI GEO GSE76496.

References

Schmitges FW, Radovani E, Najafabadi HS, Barazandeh M, Campitelli LF, Yin Y, Jolma A, Zhong G, Guo H, Kanagalingam T et al. Multiparameter functional diversity of human C2H2 zinc finger proteins. Genome Res. 2016 Dec;26(12):1742-1752. PMID: 27852650; PMC: PMC5131825

Email max@soe.ucsc.edu or jferna10@ucsc.edu